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在过去的三十年中，在线数据库、数字可视化和自动数据分析已经成为应对科学信息日益扩大的规模和多样性的关键工具。在生物学和生物医学中，人们普遍认为，对大型数据集合（所谓的大数据）的数字访问已经革命性地改变了研究方法和进行科学研究的路径，进而也对生物体的研究和概念化方式提出了挑战。一些科学家和评论家将这种情况形容为一种新颖的“数据驱动”研究范式，认为知识可以从数据中被提取，而无须依赖预先构思的假设，于是炮制出“理论的终结”一说。《如何在大数据时代研究生命：从哲学的观点看》通过提出一个哲学框架，对这些观点进行了批判性的反驳，通过这个框架，人们可以研究和理解当前生命科学中对数据的强调，以及它对整个科学领域的影响。
（节选自本书序言）
日益重要的数据哲学与数据中心型研究
自从我写这本书已经快十年了，我一直在问自己，它的内容现在是不是已经过时了。这一担忧是合理的：数据科学是所有研究领域中发展最快的，更不用说在生物学中，遥感、生物信息学、数据链接策略和人工智能(AI)的创新进一步提高了收集、流通和分析数据的潜力，对我们如何理解生命、健康和环境产生了变革性的影响。当我参观创新总部或出席研究会议时，我经常被告知，与人工智能的发展相比，关于“大数据”的讨论现在已经过时了。事实上，全球每个角落的媒体每周都在记录算法的最新成就。人工智能正在以各种方式改变社会生活，从工作模式到教育策略、研究实践、管理模式和健康监测。
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然而，这本书提出的问题——什么应当算作数据?如何管护数据，这对知识生产有什么影响?在哪些情况下可以调动数据并可靠地解释数据?——随着我们对以数据为中心的系统的依赖日益增长，变得越来越重要。数据仍然是训练人工智能系统的重要组成部分，许多专家认识到，人工智能的好坏取决于用于训练它的数据。因此，如何创建、选择、流通和再次使用数据很重要。如果不反思这些过程，就很难评估数据的可靠性和数据模型的表达能力。以数据为中心的人工智能是否产生了值得信赖的结果，例如在识别蛋白质结构或疾病的可能治疗方法时，就更难评估了。与此同时，这些技术在我们日常生活中的无处不在，培养着人们对数据的被动态度——这种被动基于这样一种信念，即对大量数据的分析必然会产生可靠的见解，因此不需要监督。许多研究人员不会问自己数据是什么，为什么我们在开发新知识时如此依赖它们。矛盾的是，以数据为中心的方法越是渗透到所有形式的研究和知识中，我们就越是倾向于信任这些系统，而它们的复杂性和不透明性如今已经超越了人类的理解，因此似乎无可挑剔。然而，并不是所有的数据基础设施和数据处理实践都值得我们信任。现在比以往任何时候都更重要的是，能够对数据系统提出疑问，并理解它们与我们生产的知识和用来干预我们星球的知识之间的关系。数据哲学不仅是一种迷人的爱好，而且是这个依赖大量数据计算系统的时代必不可少的事业。
我非常高兴我的书能够通过翻译接触到更广泛的读者，也非常感谢译者刘冠帅博士的坚持不懈和辛勤工作。我相信，近年来，无论是在生物学研究的背景下，还是在人工智能数据分析驱动的无数其他应用中，本书提出的问题都变得越来越紧迫。我会继续大量参与数据语义学、分类系统、整合和建模策略的研究，并追问这些方法对我们了解世界的影响，以及我们如何根据这些知识采取行动。我希望这本书能激励任何对生命科学感兴趣的人，以及那些努力理解大规模数据收集、数据基础设施和数据分析对其他领域所产生影响的人。
本文摘自《如何在大数据时代研究生命：从哲学的观点看》中文版序言。
书籍信息
如何在大数据时代研究生命：
从哲学的观点看
[意] 萨宾娜·莱昂内利（Sabina Leonelli）著
刘冠帅 译
2023年12月出版/定价98.00元
ISBN 978-7-5228-1991-4
社会科学文献出版社 · 思想会
内容简介
近几十年来，研究人员处理和理解科学数据的方式发生了重大转变。数据的数字化访问已经彻底改变了生物和生物医学领域的科学研究方式，引发了一种数据密集型的研究方法，这种方法通过创新来制造、存储、分发和解释体量巨大的数据。在本书中，萨宾娜•莱昂内利探讨了这些进步的含义，并直面了它们所带来的问题。我们正在见证一种全新的科学认识论的兴起吗？如果是这样，它将如何改变我们研究和理解生命——包括我们自己——的方式？
莱昂内利是第一位利用当代数据密集型科学研究对数据认识论进行哲学分析的学者。本书展现出了作者对于生命科学和生物学的深厚积累，在分析以数据为中心的生物学的兴起、内部动力和潜在影响时，她利用科学和人文学科等不同领域的大量交叉性学术成果，以及自身的原始经验材料，来确定数据的数字化获取在何种条件下可以促进我们对生命的理解。本书通过探讨以数据为中心的生物学，弥合了历史学家、社会学家和科学哲学家之间的鸿沟，并细致入微地描述了一个在理解当代科学实践方面至关重要的问题。
作者简介
萨宾娜•莱昂内利（Sabina Leonelli）是英国埃克塞特大学社会学、哲学与人类学学院教授，也是埃克塞特生命科学研究中心主任。其研究方向包括生物学哲学与历史，科学和技术研究以及一般科学哲学等领域。当前主要关注对数据密集型科学和实证探究的哲学、历史与社会研究，开放科学、模式生物的哲学和历史，以及植物科学的历史与认识论等话题。
译者简介
刘冠帅，哲学博士，社会学博士后。现任吉林大学哲学社会学院哲学系讲师，主要研究方向为科学哲学、分析哲学。
权威推荐
作为理解科学未来的关键，“数据”的含义是否发生了变化？萨宾娜•莱昂内利的新书跳出了许多哲学家的舒适区，给出了一个重要而成果斐然的答案。不仅如此，她还针对如何让科学家们处理、共享、复制、解释和存储数据时更加标准、更加自动、更易沟通提供了宝贵的见解。
——《科学哲学》（Philosophy of Science）
在这本书中，萨宾娜•莱昂内利第一次以专著的形式探究了生命科学中的数据中心主义，她在书中整合了诸种方法论与多元视角下获得的不同观点，这是非常值得称赞的成就。
——《生物学评论季刊》（Quarterly Review of Biology）
本书为大数据现象提供了全新且令人惊讶的启示。分析论证充分，历史资料充足，有高度的社会学敏感性，这本书出色且成功地展示了关于科学的哲学、历史学和社会学的融合研究会达到何种成就。
——汉斯约格·莱茵伯格（Hans-Jörg Rheinberger），马克斯·普朗克科学史研究所
书籍目录
中文版序
序言
第一部分 数据旅程
第一章 让数据迁旅：技术和专业知识
一 生物学中在线数据库的崛起
二 数据的包装与迁旅
三 数据库管护人的新兴力量
四 数据旅程和其他迁旅隐喻
第二章 管理数据旅程：社会结构
一 数据包装的制度化
二 集中化、异议和认知多样性
三 作为全球商品的开放数据
四 评估数据价值
第二部分 以数据为中心的科学
第三章 该将什么视为数据？
一 科学哲学中的数据
二 一个关系框架
三 数据的非本地性
四 包装及建模
第四章 该将什么视为实验？
一 获取具身知识
二 当标准不足时
三 数据旅程中的分布式推理
四 自动化和可复制性的梦想
第五章 该将什么视为理论？
一 迁旅数据分类
二 作为分类理论的生物本体论
三 分类的认知作用
四 分类理论的特征
五 以数据为中心的科学理论
第三部分 对生物学与哲学的影响
第六章 在数字时代研究生命
一 数据整合的多样性，理解有机体的不同方式
二 数据中心主义的影响：危险与排斥性
三 数据中心主义的创新：机会与未来发展
第七章 面向知识生产的数据处理
一 对背景的质疑
二 从背景到情境
三 数字时代的数据定位
结论
致谢
索引
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策划：张思莹
编辑：张思莹
审校：柳 杨
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